简单说下吧。

工厂：报关，收汇，核销，退税；
香港公司：提单shipper，产地证exporter，清关箱单发票的卖方；
客户：提单Consignee / Notify Party，产地证Consignee，清关箱单发票的买方；
资金流：客户汇款至香港公司离岸账户，利润留在离岸账户上，将货款以美金打给工厂，这个金额与报关金额一致，也是之前工厂对你的美金报价。

如果工厂有出口权那就很好办。你给客户发个装运请求，他就会联系他自己的货代了。然后你给货代发个BOOKING，他们订好仓会传给你进仓单。同时你把工厂的盖了章的空白报关资料拿来自己填写(在报关时候，SHIPPER 是工厂，你的香港公司是CONSIGNEE，但到出提单的时候，SHIPPER可以写香港公司)，为的保护自己的商业秘密，然后寄给货代。记得是要让工厂在出口的港口备过案，每次出货前还要到网上注册登记，工厂会帮你办的。
CONGSIGNEE 是你的客户，之后就是货代的事情了，他们会给你出提单，会发DEBIT NOTE(fob的港口费用)给你，你交完钱就可拿提单，给客户寄去，当然要在他把钱都汇到你的香港公司离岸账户的前提下。当然过10天半月后，货代这里退给的核销单和关单，你退给工厂就OK了。

如果工厂没有出口权，就买单，找货代问一下，其余的方法都是一样的。