与香港公司交易时，能否减免公司国内增值税，主要取决于具体的交易性质、税收政策以及是否满足相关的减免税条件。以下是对这一问题的详细分析：

一、增值税减免的基本原则
增值税的减免通常遵循国家税法及相关税收协定的规定。在中国，增值税的减免政策往往与鼓励特定行业、促进跨境贸易或避免双重征税等目标相关。

二、与香港公司交易的增值税处理
跨境交易性质：

如果交易涉及跨境服务或货物销售，需要特别注意增值税的处理方式。跨境交易可能受到不同国家或地区的税法管辖，因此需要了解并遵守相关的税收规定。
税收协定：

中国与香港特别行政区签订了避免双重征税和防止偷漏税的协定。根据这一协定，双方在某些情况下可以减免对方居民的增值税。例如，根据内地和香港双边税收协定，如果内地企业从香港进口货物或服务，并符合一定条件，可以享受增值税的减免。
具体减免税条件：

增值税的减免通常需要满足特定的条件。这些条件可能包括交易的性质、交易双方的身份、交易的金额以及是否涉及特定的税收优惠政策等。
三、实际操作中的注意事项
了解税收政策：

在与香港公司进行交易前，企业应充分了解相关的税收政策，包括增值税的减免政策、跨境交易的税收处理规定等。
合规操作：

企业应确保交易的真实性和合规性，避免利用虚假交易或其他非法手段逃避税收。
咨询专业机构：

对于复杂的跨境交易或涉及大额增值税的情况，企业应咨询专业的税务顾问或会计师，以确保税务处理的准确性和合规性。
四、结论
与香港公司交易时，能否减免公司国内增值税取决于具体的交易性质、税收政策以及是否满足相关的减免税条件。企业应充分了解相关的税收政策，确保交易的合规性，并在必要时咨询专业机构以获取准确的税务处理建议。

请注意，以上信息仅供参考，具体税务处理应以国家税法及相关税收协定的规定为准。