两个抬头的shipper（发货人）在国际贸易中，特别是在双抬头报关的情况下，确实可能会对退税产生影响，但这种影响并非直接由“两个抬头”本身决定，而是取决于具体的退税政策、企业资质、业务模式以及报关单上的具体填写内容。

一、双抬头报关与退税主体
在双抬头报关中，报关单上通常会出现两个单位名称：一个是“境内收发货人”（可能是代理出口的企业），另一个是“生产销售单位”（可能是实际生产或销售货物的企业）。退税的主体通常是实际承担出口货物所有权并符合退税条件的一方，即“生产销售单位”。

二、退税条件与影响
企业资质：生产销售单位必须具备进出口经营权，并符合退税的其他相关资质要求，如增值税一般纳税人资格、出口退税备案手续等。

业务模式：

委托代理出口：若生产销售单位委托外贸综合服务企业（综服企业）或其他外贸企业代理出口，退税的具体操作会有所不同。综服企业可能代为申报退税，而委托非综服企业出口时，通常由生产销售单位自行申报。
自营出口：若生产销售单位自营出口，则直接以其自身名义申请退税。
报关单填写：报关单上的填写内容需准确无误，特别是“境内收发货人”和“生产销售单位”的信息，这直接关系到退税申请的受理和审批。

退税资料：申请退税时，必须提供完整的退税申报资料，包括但不限于出口报关单、增值税专用发票等。若报关单为双抬头，则需特别注意资料的完整性和准确性。

三、特殊情况与注意事项
非医用口罩等特殊商品：在特定时期（如疫情期间），对于某些特殊商品（如非医用口罩）的出口，可能有特殊的退税政策或要求。
退税风险：双抬头报关可能增加退税的复杂性，企业应确保业务操作合规，避免因形式要件问题导致退税受阻。
四、结论
两个抬头的shipper在双抬头报关中确实存在，其对退税的影响主要取决于退税政策、企业资质、业务模式以及报关单的具体填写内容。只要企业符合退税条件，并按照规定流程操作，双抬头报关并不会直接阻碍退税申请。然而，企业在实际操作中仍需注意相关细节和特殊要求，以确保退税申请的顺利进行。