香港居民企业转让境内公司股权是否需要代扣代缴所得税，是一个涉及税法规定和实际操作的复杂问题。以下是对此问题的详细解答：

一、税法规定
企业所得税：

根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，非居民企业（包括香港居民企业）转让其在境内公司持有的股权，取得的转让所得应在中国境内缴纳企业所得税。通常情况下，税率为10%。
该所得税由受让方代扣代缴，并在其所在地主管税务机关申报缴纳。
避免双重征税协定：

香港与内地之间签订了避免双重征税的协定，该协定规定了双方在税收方面的权利和义务。根据协定，香港居民企业在内地取得的股权转让所得，在符合一定条件下，可以在香港申请税收抵免，以避免双重征税。
二、实际操作
代扣代缴：

在实际操作中，当香港居民企业转让境内公司股权时，受让方需要按照税法规定代扣代缴企业所得税。这要求受让方了解相关税法规定，并在交易过程中确保税款的正确计算和缴纳。
税务筹划：

香港居民企业在转让境内公司股权前，可以进行税务筹划，以优化税务结构并降低税负。这包括了解并利用避免双重征税协定的规定、合理安排交易结构等。
注意事项：

在进行股权转让交易时，双方应确保交易的真实性和合法性，避免通过虚假交易等手段逃避税收。
同时，双方还应关注税务政策的最新动态，以便及时调整交易策略和税务筹划方案。
三、特殊情况
如果香港居民企业在转让股权前曾经直接或间接拥有被转让公司25%以上的股份，或者该公司在转让前三年内的账面资产中有50%以上为不动产，内地税务机关可能根据相关规定行使征税权。
在这种情况下，香港居民企业需要更加关注内地税法的规定和实际操作要求，以确保税款的正确计算和缴纳。
综上所述，香港居民企业转让境内公司股权需要代扣代缴所得税。双方在进行交易时应严格遵守税法规定和相关政策要求，确保交易的合法性和税务处理的准确性。同时，双方还可以关注避免双重征税协定的规定和税务筹划的可能性，以优化税务结构并降低税负。