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港澳台独资企业可以申报高新技术企业（高企）认定，但需要满足特定条件。
首先，根据《高新技术企业认定管理工作指引》（国科发火〔2016〕195号），要认定的知识产权必须在中国境内授权或审批审定，并在中国法律的有效保护期内。这意味着，如果港澳台独资企业的知识产权是在中国境外注册，且权属人为国外控股公司或个人，那么这些知识产权将不符合高企认定的要求。
其次，根据相关规定，所谓的高新技术企业必须是在《国家重点支持的高新技术领域》内持续进行研究开发与技术成果转化的企业，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展经营活动，且必须是在中国境内（不包括港、澳、台地区）注册的居民企业。
